北京大学人类疾病基因研究中心近年主要成果

 

直属实验室

近年的主要成果

PDCD5(TFAR19)

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近年的主要成果

CKLF

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近年的主要成果

SNP

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近年的主要成果

肿瘤免疫学研究

 

 

 

 

人类程序性死亡相关基因PDCD5(TFAR19)

 


  本中心刘红涛博士等1999年1月在美国BBRC杂志首次报道了一个具有凋亡促进功能的新的人全长cDNA,命名为TFAR19(TF-1 cell apoptosis related gene 19), 进行了系统的mRNA表达研究、重组蛋白质的表达与纯化,抗体的制备,对不同细胞的体外生物活性研究,细胞内定位研究等。国际人类基因命名委员会(Homo sapiens Official Gene Symbol and Name,HGNC)已将其命名为PDCD5(programmed cell death 5)。通过对其进行了深入的功能研究和作用机理,获得了一系列重要的新发现,证明PDCD5是一个表达广泛,进化保守的基因,具有促进凋亡和促进Parapotosis的效应;PDCD5在多种肿瘤和白血病中表达下调,具有临床检测价值,并有可能作为肿瘤的凋亡促进剂应用于临床。迄今有关PDCD5的国内外论文已有50余篇,国家发明专利已经获得授权。刘红涛的博士论文2000年获全国优秀博士论文奖,2001年该项成果获中国高校自然科学一等奖。有关TFAR19(PDCD5)的主要论文如下(包括合作实验室和引用的论文):


本中心发表的PDCD5(TFAR19)的SCI论文:

1. Hongtao Liu, Yugang Wang, Yingmei Zhang, Quansheng Song, Chunhui Di, Guanghui, Chen, Jian Tang, Dalong Ma: TFAR19, a novel apoptosis-related gene cloned from human leukemia cell line TF-1, could enhance apoptosis of some tumor cells induced by growth factor withdrawal. Biochem Biophy Res Comm, 1999, 254:203-210 download

2.Yingyu Chen, Ronghua Sun, Wenling Han, Yingmei Zhang, Quansheng Song, Chunhui Di, Dalong Ma。Nuclear translocation of PDCD5 (TFAR19): an early signal for apoptosis? FEBS Letter,2001,509(27): 191-1964. download


3.Min Rui, Yingyu Chen, Yingmei Zhang, Dalong Ma. Transfer of anti-TFAR19 monoclonal antibody into HeLa cells by in situ electroporation can inhibit the apoptosis. Life Science, 2002, 71(15): 1771-1778 download


4.Ying Wang, Xianting Li, Lu Wang, Peiguo Ding, Yingmei Zhang, Wenlin Han, Dalong Ma. An alternative form of paraptosis-like cell death, triggered by TAJ/TROY and enhanced by PDCD5 overexpression. J.Cell.Sci.,2004(117):1525-1532download


5.Mingxu Xu, Cheng, L. Gui, M. Lai, Y. Wang, D. Xia, M. Rui, Y. Zhang, D. Ma The 5'-upstream region of human programmed cell death 5 (PDCD5) gene contains a highly active TATA-less promoter that is up-regulated by etoposide. Gene, 2004, 329: 39-49


6. Cheng AX, Lou SQ, Zhou HW, Wang Y, Ma DL: Expression of PDCD5, a novel apoptosis related protein, in human osteoarthritic cartilage.Acta Pharmacol Sin. 2004 May;25(5):685-90.download


其它实验室引用PDCD5(TFAR19)SCI论文

 

1.D.Christendat, A.Yee, A.Dharamsi, et al. Structural proteomics of an archaeon, Nat.Struct.Biol. 2000, 7:903-909.download


2.Hedenfalk I., Duggan D, Chen Y, et al. Gene-expression profiles in hereditary breast cancer. N Engl J Med, 2001; 344:539-548.download


3. Feng Y, Zhang Y, Jing G,Soluble expression in Escherichia coli, purification and characterization of a human TF-1 cell apoptosis-related protein TFAR19.Protein Expr Purif 2002,25(2):323-9download


4. Michael J. Renzi , Francis X. Farrell , Anton Bittner , Jose E. Galindo , Mike Morton ,Heather Trinh , Linda K. Jolliffe: E rythropoietin induces changes in gene expression in PC-12 cells. Molecular Brain Research 104 (2002) 86-95download


5. Cecconi D, Scarpa A, Donadelli M, Palmieri M, Hamdan M, Astner H, Righetti PG:Proteomic profiling of pancreatic ductal carcinoma cell lines treated with trichostatin-A.Electrophoresis. 2003 Jun;24(11):1871-8.


6. Zhang X, Guo P, Jing G. A vector with the downstream box of the initiation codon can highly enhance protein expression in Escherichia coli.Biotechnol Lett. 2003 May;25(10):755-60.


7. GU Li, YAO Weijuan, YAN Zongyi,XIE Lide, SUN Dagong, LI Dan,ZENG Zhu & WEN Zongyao: Effects of TFAR19 gene on the growth and biorheological properties of mouse erythroleukemia cell line MEL. SCIENCE IN CHINA (Series C) 2003, 46(3):293-301download


8. Cheng Y, Liu D, Feng Y, Jing G. An efficient fusion expression system for protein and peptide overexpression in Escherichia coli and NMR sample preparation.Protein Pept Lett. 2003 Apr;10(2):175-81.


9. Hilda Petrs-Silva, Fabi′Ola G. De Freitas, Rafael Linden, and Luciana B. Chiarini. Early Nuclear Exclusion of the Transcription Factor Max Is Associated With Retinal Ganglion Cell Death Independent of Caspase Activity.Journal of Cellular Physiology.2004, 198:179-187 (引用陈英玉FEBS Letter论文)


10. Hazel M. Robinson, Kerry E. Taylor, G. Reza Jalali, Kan Luk Cheung, Christine J. Harrison, and Anthony V. Moorman: t(14;19)(q32;q13): A Recurrent Translocation in B-Cell Precursor Acute Lymphoblastic Leukemia Genes, Chromosomes & Cancer 2004 39:88-92

11. CR. Buscha, DD. Heatha, A. Hubberstey. Sensitive genetic biomarkers for determining apoptosis in the brown bullhead (Ameiurus nebulosus).Gene 2004, 329 1-10


12. Liu D, Feng Y, Cheng Y, Wang J. Human programmed cell death 5 protein has a helical-core and two dissociated structural regions. Biochem Biophys Res Commun. 2004 May 28;318(2):391-6.download


13. John D. Storey and Robert Tibshirani Statistical significance for genomewide studies.PNAS 2003, 100:9440-9445download


14. 田辉凯. 夏天. 蒋春笋. 张红梅. 王坤. 李学军:TFAR19促进小鼠肝线粒体膜通透性转运孔的开放. 生物化学与生物物理学报 2002年03期download

15.Anthony T. Dobson, Rajiv Raja, Michael J. Abeyta, Theresa Taylor, Shehua Shen, Christopher Haqq, and Renee A. Reijo Pera:The unique transcriptome through day 3 of human preimplantation development. Hum. Mol. Genet.2004;13:1461-1470 (引用芮珉Life Science论文)


16. Weaver JC: Electroporation of Biological Membranes from Multicellular to Nano Scales. IEEE Transactions on Dielectrics and Electrical Insulation. 2003, 10(5):754-768(引用芮珉Life Science论文)


17.Ortega, A., Ferrer, P., Carretero, J., Obrador, E., Asensi, M., Pellicer, J.A., Estrela, J.M:Down-regulation of glutathione and Bcl-2 synthesis in mouse B16 melanoma cells avoids their survival during interaction with the vascular endothelium.JBC,2003, 278(41): 39591-39599(引用芮珉Life Science论文)download


18. Sinha, SK., Chaudhary, PM: Induction of apoptosis by X-linked ectodermal dysplasia receptor via a caspase 8-dependent mechanism.JBC, 2004, 279(40): 41873-41881(引用王莺JCS论文)download


19.Zucchi I, Mento E, Kuznetsov VA: Gene expression profiles of epithelial cells microscopically isolated from a breast-invasive ductal carcinoma and a nodal metastasis.PNAS,2004, 101:18147-18152. (引用陈英玉FEBS Letter论文)download

 

PDCD5(TFAR19)的中文论文(包括其它实验室论文):


1.刘红涛,王玉刚,张颖妹,等. TF-1细胞凋亡相关基因的研究. 生物化学与生物物理进展,1999,26(1):38-43download


2.张颖妹 徐秀珍 刘红涛 宋泉声 马大龙. 人重组TFAR19蛋白对白血病细胞株HL-60的促凋亡效应. 中国免疫学杂志,2000,16(1):8-11 download


3. 李惠平,曹志敏,邵玉霞,孙武,朱英葆,贾廷珍。重组人TFAR19蛋白与羟基喜树碱联用对人7721肝癌细胞周期和诱导凋亡的影响。北京医科大学学报,2000,32(5):408 download


4.陈英玉,张颖妹,孙荣华,宋泉声,狄春辉,马大龙。抗人凋亡相关蛋白TFAR19的单克隆抗体制备及鉴定。中国医学科学院学报,2000,22(6):502 download


5.宋泉声,韩文玲,刘红涛,马大龙。小鼠凋亡相关新基因TFAR19 cDNA的克隆化和序列分析。北京医科大学学报,1999,31(4):309-311 download


6.曹志敏,张颖妹,陈英玉,马大龙。人TFAR19的定点突变及其重组蛋白的表达、纯化和功能分析。北京医科大学学报,2000,32(4):306 download


7. 焦建峰 陈冠英 黄玫 管增伟 石爽 张颖妹 马大龙 。 rhTFAR19蛋白质对γ射线诱导MCF-7细胞周期及凋亡影响的初步研究.中华肿瘤杂志, 2000年, 22(2):102-4 download


8. 李莉,陈英玉,郑蕊,马大龙,王德炳。几种不同方式诱导Jurkat细胞凋亡过程中TFAR19的表达。中国实验血液学杂志,2000;8(2):81-84download


9。陈英玉 孙荣华 韩文玲 张颖妹 宋泉声 狄春辉 马大龙. 凋亡相关蛋白TFAR19 在TF-1细胞凋亡中出现细胞核转位. 北京大学学报医学版,2001,33(2):97-100 download


10.王应, 张颖妹, 杨田,周周,狄春辉,马大龙:果蝇程序化死亡基因5(PCDC5)同源cDNA的克隆和序列分析。中国生物化学与分子生物学报。2001,17(2):142-147 download


11. 史须. 黄家强. 张颖妹. 宋泉声. 马大龙: 人TRAIL cDNA的真核表达和体外肿瘤细胞的凋亡诱导作用 中国医学科学院学报, 2001, download


12. 田辉凯 夏天 蒋春笋 等, TFAR19促进小鼠肝线粒体膜通透性转运孔的开放。生物化学和生物物理学报,2002,34(3):279-284 download


13. 秦虹. 刘祖国. 郝燕生. 王薇. 陈英玉:.凋亡相关蛋白TFAR19在老年性白内障晶状体上皮细胞中的表达与定位. 眼科研究, 2002年06期download


14. 冯静. 崔恒. 魏丽惠. 马大龙: TFAR19蛋白在卵巢上皮性癌中的表达.中国妇产科临床杂志,2002年03期download


15.宋清华. 狄春晖. 钟英城. 陈学荣. 李世荫:系统性红斑狼疮与TFAR19的相关性的研究。中华风湿病学杂志. 2002年05期download


16. 阮国瑞, 陈珊珊, 常艳,等.一个新的凋亡促进分子-TFAR19在成人慢性髓性白血病骨髓细胞的异常表达. 北京大学学报医学版,2002,34(6):676-679 download


17. 李现亭,莫晓宁,夏东岚,刘雅楠,宋泉声,张颖妹,马大龙, 人凋亡相关基因TFAR19缺失突变体的原核表达、产物纯化及鉴定.中国生物化学与分子生物学报。2002,18(4):411-415 download


18. 程爱新,王莺,马大龙,周昊嵬,娄思权。程序化死亡基因5(PDCD5)在骨关节炎软骨中的表达及意义。北京大学学报(医学版),2003,35(5):481-484download


19. 宋清华. 王晶. 陈英玉. 狄春晖. 孙荣华. 陈学荣. 李世荫.TF-1细胞凋亡相关基因19在系统性红斑狼疮发病中的作用.中国病理生理杂志 2003年02期download


20. 杜颖. 洪天配:TF-1细胞凋亡相关基因19与甲状腺肿瘤之间关系的初步探讨.中华内科杂志. 2003年07期download


21. 郑霙,马大龙。人程序化死亡分子5(PDCD5)核酸和蛋白质序列的数据发掘。北京大学学报(医学版)。2003,34(4):353-359 download


22. 宋清华. 陈英玉. 狄春晖. 陈学荣. 李世荫.TFAR19蛋白在系统性红斑狼疮患者血清中水平的检测.中华风湿病学杂志.2003年09期download


23.王露,范慧,莫晓宁,张颖妹,魏征人,钟英成,黄大无。重组凋亡相关蛋白PDCD5的纯化及稳定性。北京大学学报(医学版)。2003,34(4):360-363 download


24.李欣,黄建萍,丁洁:新的凋亡相关基因PDCD5在狼疮性肾炎患儿肾组织中的表达.临床儿科杂志.2003,21(10):607-609download


25.宋清华. 狄春晖. 陈英玉. 钟英诚. 陈学荣. 李世荫.中波紫外线诱导HaCaT细胞凋亡中TF-1细胞凋亡相关基因19的表达.临床皮肤科杂志.2003,32(09):506-508download


26. 王海宁,杜颖,洪天配:TF-1 细胞凋亡相关基因19 在桥本病甲状腺细胞中的表达. 中华内分泌代谢杂志.2004, 20(2):119-120download


27. 何焱玲. 齐焕英. 闻卫兢. 王卉. 朱铁君:银屑病患者皮损表皮细胞促凋亡分子PDCD5表达的研究 中华皮肤科杂志 2004, 37(04):215-217download


28. 顾黎,谢利德,姚伟娟,喀蔚波,孙大公,文宗曜:FTIR 对TFAR19 基因促红白血病MEL细胞凋亡作用的研究. 生物医学工程学杂志.2004; 21 (3)∶449~ 452download


29. 刘朝晖, 张岱, 李克敏, 廖秦: PDCD5 蛋白在正常宫颈、宫颈上皮内瘤样病变和宫颈癌中的表达. 北京大学学报(医学版)。2004,36(4):407-410download


30. 张岱, 刘朝晖, 李克敏, 范慧,廖秦:重组人PDCD5蛋白对干扰素γ诱导人宫颈癌SiHa细胞凋亡的增敏作用的初步探讨. 中国妇产科临床杂志。2004,5 (5 ):286-289 download

PDCD5(TFAR19)相关的综述

1.马大龙:新细胞因子及细胞凋亡基因的发现与功能研究。北京大学学报(医学版) 2002年05期download


2.王建华, 杨志杰:细胞凋亡相关基因TFAR19研究进展。医学综述, 2003年12期download


3.杨银峰,李家林:细胞凋亡相关基因与人类肿瘤 ,生命的化学,2004年03期download


4.马大龙:我国人类功能基因研究进展。北京大学学报(医学版),2003年04期download


5.李红艳. 刘永明:细胞凋亡相关新基因TFAR19(PDCD5)研究进展。华夏医学,2004,17(3):459-461download

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新的人类细胞因子CKLF家族的克隆、表达和功能研究


  本中心韩文玲博士等2001年7月在英国Biochem J首次报道利用IL-10为广谱细胞因子抑制因子的特点,通过SSH技术克隆U937细胞被IL-10抑制的cDNA,发现新的细胞因子CKLF1(Chemokine-like factor 1,原名UCK-1,U937 derived chemokine-1)及其变异体CKLF2,3,4。CKLF1具有趋化效应、促进骨髓细胞集落形成效应和刺激骨骼肌细胞效应,在机体发挥重要的生理和病理作用,特别是在自身免疫型炎症反应中发挥重要作用。CKLF结构独特,属于国际上首次发现的一个新细胞因子家族,对其结构与功能进行深入研究具有重要的理论研究意义和实用意义。本工作2001年以来发表论文7篇,并申请了国际和国内发明专利。韩文玲的博士论文2002年获全国优秀博士论文奖。

 

CKLF1

有关CKLF1的主要论文和专利如下(包括合作实验室的论文和专利):

1. Wenling Han, Yaxin Lou, Junmin Tang, Yingmei Zhang, Yingyu Chen, Ying Li, Weifeng Gu,Jiaqiang Huang, Liming Gui, Yan Tang, Feng Li, Quansheng Song, Chunhui Di, Lu Wang, Qun Shi, Ronghua Sun, Donglan Xia, Min Rui, Jian Tang, Dalong Ma et al: Molecular cloning and characterization of chemokine-like factor 1 (CKLF1), a novel human cytokine with unique structure and potential chemotactic activity. Biochem J. 2001, 357, 127-135 download chinese


2. 马大龙,韩文玲,张颖妹,宋泉声,狄春辉,黄家强,汤健,陈光慧。Chemokine-like factors having cell chemokinesis function and proliferation-stimulating activity.国际专利号PCT/CH00/00026;美国专利号09/801,115;欧洲专利号:EP0198P.

3. 钟南山,谭亚夏,马大龙,韩文玲,宋泉声,陈英玉。趋化素样因子-1在器官炎性损伤中的用途.中国发明专利申请号01139963.5 ,2002

4王露,马大龙,韩文玲,范慧,张颖妹,宋泉声,狄春辉。具有造血刺激和免疫调节作用的细胞因子CKLF-H1A 及其变异体CKLF-H1B。中国发明专利申请号00121027.0,2001

5. Wenling Han, Donglan Xia, Yaxin Lou, Min Rui, Quansheng Song, Yingmei Zhang, Chunhui Di, Dalong Ma.(Poster). The stimulating effect of chemokine-like factors (CKLFs) on skeletal muscle cells. Cell. Biology. International. 2001,25(10):1053-1054 (Abstract).

6. 徐志伟,邓鸿业,马大龙,趋化因子样因子-1的体内表达对BXSB狼疮鼠发病影响的研究. 中华风湿病学杂志.2001,5(3):162 download

7. 韩文玲,芮珉,张颖妹,陈英玉,钟英成,狄春辉,宋泉声,马大龙:趋化素样因子(CKLF1)对骨髓细胞增殖活性的研究. 中国医学科学院学报,2001,23(2):119-122 download

8.夏东岚 娄雅欣 韩文玲 李现亭 宋泉声 张颖妹 马大龙.大鼠趋化素样因子(rCKLF1, 2)对成肌细胞促增殖作用的研究. 细胞与分子免疫学杂志,2002,18(4):313 download

9.Donglan Xia, Xianting Li, Yaxin Lou, Wenling Han, Peiguo Ding, Yingmei Zhang, Chunhui Di, Quansheng Song, Dalong Ma:: Overexpression of chemokine-like Factor 2 promotes the proliferation and differentiation of C2C12 skeletal muscle cells. Biochimica et Biophysica Acta-MOL CELL RES. 2002, 1591 (1-3):163-173. download

10. 夏东岚 陈英玉 韩文玲 李现亭 宋泉声 张颖妹 马大龙:人趋化素样因子2对小鼠成纤维细胞BALB/c3T3的促增殖和凋亡抑制作用。中华微生物学和免疫学杂志。2003,23(1):5-8 download

11. Yaxin Lou, Donglan Xia, Wenling Han, Ying Wang, Xianting Li, Ying Li, Min Rui, Peiguo Ding,Quansheng Song, Yingmei Zhang, Dalong Ma* Molecular cloning and characterization of rat chemokine-like factor 1 and 2.Gene 2003, 307C pp. 125-132 download

12. Min Rui, Donglan Xia, Yingmei Zhang, Wenling Han, Lu Wang, Peiguo Ding, Yingcheng Zhong, Quansheng Song, Dalong Ma. Molecular cloning and characterization of four isoforms of mCKLF, mouse homologues of human chemokine-like factor. Molecular Breeding 30: 229–237, 2003. download

13. 克晓燕 贾丽萍 景红梅 刘彦 张颖妹 狄春晖:新的人趋化素样因子对骨髓造血干/祖细胞的体外刺激作用。中华血液学杂志。2002,23(6):301-303 download

14.程爱新,韩文玲,马大龙,娄思权。趋化素样因子1(CKLF1)对关节软骨细胞增殖及代谢的影响。北京大学学报(医学版)。2003,34(4):399-401 download

 

CKLFSF

有关CKLFSF的主要论文和专利如下(包括合作实验室的论文和专利):

1.韩文玲,马大龙,丁培国. 具有骨骼肌刺激活性和免疫调节作用的趋化素样因子超家族。中国发明专利申请号02122266.5,2002

2. Wenling Han,Peiguo Ding,Mingxu Xu,Lu Wang, Min Rui,Shuang Shi,Yanan
Liu,Ying Zheng,Yingyu Chen,Tian Yang,Dalong Ma. Identification of eight
genes encoding chemokine-like factor super family members 1-8
(CKLFSF1-8) by in silico cloning and experimental validation. Genomics
2003,81(6): 609-617 download

3.Lu Wang(王露); Chunxiao Wu(武春晓); Ying Zheng; Xiaoyan Qiu; Li Wang; Hui Fan; Wenling Han; Bingfeng Lv; Ying Wang; Xiaohui Zhu; Mingxu Xu; Peiguo Dinga; Shanhong Cheng; Yingmei Zhang; Quansheng Song; Dalong Ma: Molecular Cloning and Characterization of Chemokine-like Factor Super Family Member 1 (CKLFSF1), a Novel Human Gene with at Least 23 Alternative Splicing Isoforms in Testis Tissue. Int.J.Biochem.Cell.B.2004, In press.

4.Mingxu Xu(徐明旭), Wenling Han, Mingping Qian, Xiaotu Ma, Peiguo Ding, Ying Wang, Donglan Xia, Min Rui, Lu Wang, Yinmei Zhang, and Dalong Ma. Last intron of the chemokine-like factor gene contains a putative promoter for the downstream CKLF super family member 1 gene. Biochem. Bioph. Res. Co.2004,313: 135-141

5.Shuang Shi(石爽),Min Rui, Ying Wang, Xiaoyan Qiu, Peiguo Ding, Pei Zhang, Xiaohui Zhu, Yingmei Zhang, Qini Gan, Dalong Ma,Wenling Han: CKLFSF2 is highly expressed in testis and can be secreted into the seminiferous tubules. Int.J.Biochem.Cell.Bio. 2004, in press

 

SNP研究

1.Ying Wang(王莹), Hongshan Zhao(赵红珊), X Zhan Hailan Feng, Novel Identification of a Four-base-pair Deletion Mutation in PITX2 in a Rieger Syndrome Family. J. Dent. Res, 2003, 82(11):1007-1011

2.Qiyan Li(李启艳), Hongshan Zhao(赵红珊), Hailan Feng et al:Association analysis between IL-1 family polymorphisms and aggressive periodontitis in Chinese. Journal of Periodontology.2004, in press

 

肿瘤免疫学研究

1.Xiaoyan Qiu(邱晓彦), Xiaohui Zhu, Liang Zhang, Yuntao Mao, Jian Zhang, Peng Hao, Guohui Li, Peng Lv, Zhixin Li, Xin Sun, Lemeng Wu, Jie Zheng, Yuqing Deng, Chunmei Hou, Peixian Tang, Shuren Zhang and Youhui Zhang. Human Epithelial Cancers Secrete Immunoglobulin G with Unidentified Specificity to Promote Growth and Survival of Tumor Cells. Cancer Research, 2003(63): 6488-6495(2002 IF 8.317)

2004.6