目的：

分析预测的SARS冠状病毒的S蛋白及1a蛋白的种系进化。

方法：

根据冠状病毒分类学收集冠状病毒三个群（group）的S蛋白和1a蛋白[1],采用clustal W[2]进行多序列比对及进化树分析，用Treeview[3]显示进化树结果。

结果：(点击放大)

　　　图1 S蛋白进化树

　　　图２　1a蛋白进化树

结论：

SARS冠状病毒S蛋白和1a在进化上不属于已知的冠状病毒三个群。

参考文献：

1. Luis Enjuanes, Isabel Sola, Fernando Almazan, Javier Ortego, Ander Izeta, Jose M. Gonzalez, Sara Alonso, Jose M. Sanchez, David Escors,Enrique Calvo, Cristina Riquelme, Carlos Sanchez. Coronavirus derived expression systems. Journal of Biotechnology 88 (2001) 183–204

2.Higgins D., Thompson J., Gibson T.Thompson J.D., Higgins D.G., Gibson T.J.(1994). CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressivemultiple sequence alignment through sequence weighting,position-specific gap penalties and weight matrix choice.Nucleic Acids Res. 22:4673-4680

3.Page, R. D. M. 1996. TREEVIEW: An application to display phylogenetic trees on personal computers. Computer Applications in the Biosciences 12: 357-358

北京大学人类疾病基因研究中心

2003年4月30日

2003年５月１日更新