国家人类基因组北方研究中心功能基因组实验室 与北京大学人类疾病基因研究中心合作, 共同致力于人类功能基因组学研究,包括开展高通量的人类功能基因克隆表达和规模化人类重组蛋白表达工作;建立含有全套生物信息学信息的遴选基因二级数据库,特别是可以作为药物靶标和基因工程药物的人类功能基因数据库;以及建立高通量、高内涵的人类功能基因筛选和初步的功能基因系统性研究体系。形成了从大规模生物信息学分析、基因克隆、高通量功能基因筛选平台的建立到单个重要生理活性的功能基因系统研究、靶标分析以及针对靶标的小分子药物筛选一整套技术路线。建立我国独具特色的人类功能基因研究与开发的技术平台是我们坚定不移的科研目标。
自本实验室成立至今,已承担国家科技攻关项目:功能基因组和生物芯片,以及北京市科技计划重大项目:人类重要功能基因编码蛋白质研究及重大疾病遗传资源的收集。正在开展国家 863 重大专项“功能基因组与蛋白质组”的课题(人类重要生理功能基因的开发研究),以及国家 863 重点项目“基于功能基因组和结构基因组的药物分子设计”的子课题(以新功能基因为靶标的药物小分子化合物的筛选、设计及优化)等多项科研项目。迄今已发表 SCI 收录论文 15 篇, 申请专利 15 项,其中 2 项获得授权 (见附件) 。
本实验室为了适应科研项目拓展的需要,加强对外交流,特开展接受合作培养研究生,参与本实验室课题的实施, 包括建立功能基因筛选平台、进行功能基因筛选与单个基因功能研究等。同时本 实验室将提供优越的实验条件和系统性的培训让有志于来本实验室从事合作研究的研究生有所学,学有所用。接受条件包括但不限于如下几点:
1 、以在读二年级研究生(硕士生或博士生)为主,优先考虑 5 年制的硕博连读或直博生。
2 、有一定生物化学、分子生物学及细胞生物学实验技术基础。
3 、熟悉临床疾病的标本采集、分子分型或诊断技术(临床科研单位)。
4 、对功能基因组学(含生物信息学)和针对基因靶标的药物筛选及功能研究有一定了解。
5 、根据承担的课题情况另行商议培养条件、论文署名、经费等。
国家人类基因组北方研究中心
功能基因组实验室
联系人:石太平
Email: taiping_shi@yahoo.com.cn
Tel: 010-67883332-868/880
Fax: 010-67873016
2008 年 4 月 12 日
附件:
一、发表论文
Lan Wang, Xia Gao, Peng Gao, et al. Cell-based screening and validation of human novel genes associated with cell viability. J Biomol Screen 2006, Jun; 11(4): 369-376.
Bingfeng Lv, Taiping Shi, Xinyu Wang, et al. Overexpression of the novel human gene, nuclear apoptosis-inducing factor 1, induces apoptosis. Int J Biochem Cell Bio 2006, 38: 671-683. (与北京大学人类疾病基因中心合作)
BingFeng Lv, ChuanFei Yu, YingYu Chen, et al. Protein tyrosine phosphatase interacting protein 51 (PTPIP51) is a novel mitochondria protein with an N-terminal mitochondrial targeting sequence and induces apoptosis. Apoptosis 2006, Sep; 11(9): 1489-1501. (与北京大学人类疾病基因中心合作)
Pingzhang Wang, Taiping Shi, Dalong Ma. Cloning of a novel human Caspase-9 splice variant containing only the CARD domain. Life Sciences 2006, Aug 1; 79(10): 934-940.
Tian L, Wang P, Guo J, Wang X, et al. Screening for novel human genes associated with CRE pathway activation with cell microarray. Genomics 2007, 90(1): 28-34.
Jin X, Sun Y, Zhang K, et al. Ectopic neocartilage formation from predifferentiated human adipose derived stem cells induced by adenoviral-mediated transfer of hTGF beta2. Biomaterials 2007, 28(19): 2994-3003. (与北医三院合作)
Wang L, Yu CF, Lu Y, et al. TMEM166, a novel transmembrane protein, regulates cell autophagy and apoptosis. Apoptosis 2007, 12(8): 1489-502. ( 与北京大学人类疾病基因中心合作 )
Ma X, Wang X, Gao X, et al. Identification of five human novel genes associated with cell proliferation by cell-based screening from an expressed cDNA ORF library. Life Sciences 2007, 81(14): 1141-1151.
Wang H, Wang P, Sun X, et al. Cloning and characterization of a novel caspase-10 isoform that activates NF-kB activity. BBA 2007, 1770:1528-1537. (与上海睿星基因公司合作)
Jin XB, Sun YS, Zhang K, et al. Tissue engineered cartilage from hTGF beta2 transduced human adipose derived stem cells seeded in PLGA/alginate compound in vitro and in vivo. J Biomed Mater Res A 2007 Dec 13 [Epub ahead of print]. (与北医三院合作)
武春晓,石太平,马大龙:细胞筛选平台在人类功能基因组研究中的应用。 生物化学与生物物理进展 2005, 32(11): 1003-1010.
Wang L, Shi TP, Wang L, et al. Cloning, expression and subcellular localization of a novel human gene-RNF122. Beijing Da Xue Xue Bao 2006, Jun 18; 38(3): 239-243.
骆叶,王兰,高霞等:利用线粒体膜电位测定筛选参与细胞凋亡的人类新基因。 生物化学与生物物理进展 2007, 34(6): 1-6.
Huang J, Shi T, Ma T, et al. CCDC134, a novel secretory protein, inhibits activation of ERK and JNK, but not p38 MAPK. Cell Mol Life Sci 2008 Jan; 65(2):338-49. (与北京大学人类疾病基因中心合作)
Yu C, Wang L, Lv B, et al. TMEM74, a lysosome and autophagosome protein, regulates autophagy. Biochem Biophys Res Commun 2008 May 2; 369(2):622-629. (与北京大学人类疾病基因中心合作)
Wang L, Deng W, Shi T, et al. URP2SF, a FERM and PH domain containing protein, regulates NF-kappaB and apoptosis. Biochem Biophys Res Commun 2008 Apr; 368(4):899-906. (与北京大学人类疾病基因中心合作)
二、申请专利
1 、专利申请号: 200510011149.0 ,抑制人体转录因子 AP-1 的基因及其编码多肽和用途。
专利申请号: 200510085500.0 , 诱导细胞凋亡的多核苷酸及其编码多肽和用途 。
专利申请号: 200510112975.4 ,细胞增殖相关的多核苷酸及其编码多肽和用途。
专利申请号: 200510112974.X ,促进人体转录因子 NF- κ B 活化的多核苷酸及其编码多肽和用途。
专利申请号: 200510102772.7 ,影响 SRE 活性的多核苷酸及其编码多肽和用途。
专利申请号: 200510112972.0 , BPY2IP1 基因在抑制 CRE 活化上的应用。
专利申请号: 200510112970.1 ,影响 ELK1 活性的多核苷酸及其编码多肽和用途。
专利申请号: 200510112973.5 ,激活 CRE 活性的多核苷酸及其编码多肽和用途。
专利申请号: 200610160760.4 ,人类新细胞因子及其用途。
专利申请号: 200610165851.7 ,线粒体膜电位下降相关的多核苷酸及其编码多肽和用途。
专利申请号: 200510134520.2 ,一种骨质疏松相关基因及其编码蛋白和用途。
专利申请号: 200510134521.7 ,抑制 Wnt 活性的多核苷酸及其编码多肽和用途。
专利申请号: 200710064183.3 ,一种肿瘤相关蛋白及其编码基因与应用。
授权专利号: ZL 2004 1 0009098.3 , 抑制 NF- κ B 和 NFAT 活化的基因及其编码的多肽。
授权专利号: ZL200510103026.X ,一种肿瘤相关蛋白及其编码基因与应用。