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一 发现和命名
本中心与国家人类基因组北方研究中心合作,利用高通量的 NF- k B 信号通路细胞筛选平台,筛选发现人类新的未知基因 URP2SF ( GenBank 命名)能够抑制 NF- k B 通路的转录活性。
二 结构和表达谱
URP2 ( U NC-112 r elated p rotein 2 )是一类含有 FERM ( filopodin and ezrin/radixin/moesin )和 PH ( pleckstrin homology )结构域的蛋白家族成员之一。由于与线虫 UNC-112 序列高度的同源性而得名,此类蛋白家族中还包括 URP1 和 MIG2 。在蛋白质水平上, URP2 与 URP1 ( 58.7% )和 MIG2 ( 67.9% )具有高度的同源性。 FERM 结构域主要参与细胞骨架成分与跨膜蛋白的连接,含有 FERM 结构域的蛋白会通过这一结构域直接或间接地与胞浆膜相连,在细胞膜结构的形成与细胞黏附中发挥作用。 PH 结构域也作为细胞膜的锚定结构域,能够与磷酸肌醇相连,参与细胞信号转导蛋白间的相互作用。 URP2 有两种异构体,一种是编码 667 个氨基酸的 URP2LF ( URP2 long form ),另一种是编码 663 个氨基酸的 URP2SF ( URP2 short form )。对于 URP2 基因的功能研究至今国内外未见报道。
人类 URP2SF 基因定位于 11q13.1 ,由 15 个外显子和 14 个内含子组成,剪切符合 GT-AG 规律。 cDNA 序列全长 2506 bp ,编码 663 个氨基酸。分子量 75.3 kDa ,预测的等电点为 6.3 。 URP2SF 进化保守,在人类、猩猩、猴、牛、马等物种中存在同源物。
将 URP2SF 基因序列送到 Unigene 数据库进行 EST 组织表达分析,发现该基因主要表达于免疫系统中。通过 Northern blot [1] 和 RT-PCR 证明了 URP2SF 的存在,我们的 RT-PCR 实验也验证了 URP2SF 表达于多种造血来源的细胞系,如 Jurkat 、 U937 、 Raji 和 K562 等。
三 功能
通过构建 pEGFP-N1-URP2SF 质粒表达 GFP 融合蛋白显示, URP2SF 在细胞内呈全细胞定位。功能研究表明,过表达 URP2SF 能够抑制 NF- k B 通路的转录活性。 EMSA 实验显示, URP2SF 能够抑制 NF- k B 的核转位以及与 DNA 结合。此外,过表达 URP2SF 还能够诱导 HEK293T 和 HeLa 细胞出现了凋亡的特征,如染色体固缩和 PS 外翻。进一步研究提示,利用有效的 siRNA 下调 URP2SF 的内源性表达能够活化 NF- k B 通路,同时抑制 TNF-α 所诱导的细胞凋亡的发生。
综上所述, URP2SF 是一个新的 NF- k B 通路的抑制子,并且参与到细胞凋亡过程中。这是在国际上对 URP2SF 重要的生物学活性的首次报道 [2] ,深入对其基因、蛋白结构以及分子作用机制上的研究,将有助于阐明 URP2SF 参与 NF- k B 通路和细胞凋亡的关系,为 URP2SF 潜在的抗肿瘤的临床应用奠定基础。
四 合作意想
目前,本中心正在进一步开展 URP2SF 的功能和分子作用机理的研究。本中心已经构建了 URP2SF 真核表达质粒、 GFP 细胞定位表达质粒、腺病毒表达克隆等,希望与基础以及临床研究的实验室合作开展 URP2SF 的功能研究,特别是在免疫靶标的临床应用方面。
联系人:石太平, Tel : 67883332-868 ; Email : taiping_shi@yahoo.com.cn
参考文献
Weinstein EJ, Bourner M, Head R, Zakeri H, Bauer C, Mazzarella R, URP1: a member of a novel family of PH and FERM domain-containing membrane-associated proteins is significantly over-expressed in lung and colon carcinomas. Biochim Biophys Acta. 2003, 1637: 207-216.
Wang L, Deng WW, Shi TP, Ma DL. URP2SF, a FERM and PH domain containing protein, regulates NF-kappaB and apoptosis. Biochem Biophys Res Commun. 2008
368(4): 899-906
北京大学人类疾病基因研究中心
2008.2.27
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