Caspase-10γ
 

 


一、发现与命名


国家人类基因组北方研究中心利用生物信息学技术,通过对一条非特异性扩增产物序列进行分析,并根据内含子-外显子的剪接规律,成功预测并克隆到人Caspase-10的一个新的剪接体(详细预测与分析信息参见专利200610023191.9)。由于GenBank数据库中已经存在A-F共6个剪接体,故将新的剪接体命名为caspase-10γ[1]。


二、结构和表达谱


Caspase-10
γcDNA长1127bp,编码247个氨基酸,预测的分子量约30kDa。Caspase-10共有11个外显子,分别在两个不同的染色体位置存在Poly(A)信号,而Caspase-10g则在Caspase-10的第5个和第6个外显子之间多出了一个新的外显子,长287bp,存在Poly(A)信号。新外显子含Caspase-10g的终止密码子,导致Caspase-10γ仅含有DED结构域(death effector domain),而不含有保守的具有催化活性的CASP结构域。
RT-PCR结果表明,Caspase-10
γ 广泛表达于各种组织或细胞系。根据Caspase-10γ特异性的抗体对HeLa、Jurkat细胞系的蛋白检测结果,表明Caspase-10γ 是一个天然存在的蛋白,并且在HeLa、Jurkat细胞系中与Caspase-10的其他剪接体Caspase-10α和Caspase-10δ共表达。

三、功能


本中心与上海睿星基因技术有限公司的研究团队共同研究了Caspase-10
γ的功能与可能的功能机制,发现Caspase-10γ强烈的激活NF-κB的活性(在本中心高通量的双报告基因筛选平台中,Caspase-10γ激活NF-κB的能力可以达到空载对照的100倍),且具有轻微的促进凋亡作用,但是促凋亡能力比全长形式的Caspase-10明显减弱。实验结果还表明,与Caspase-10α共表达时,Caspase-10γ并不能抑制Caspase-10α的促凋亡作用。免疫共沉淀结果表明Caspase-10γ能够与RIP 、TRAF等分子相互作用,提示Caspase-10γ可能与NF-κB信号转导通路中多种重要的分子直接作用,从而参与调节NF-κB的活化。

四、合作意向


由于Caspase-10与多种肿瘤、免疫系统失调等密切相关。本中心拟进一步开展Caspase-10γ与其他剪接体在促进肿瘤的发生、细胞凋亡与免疫系统疾病等之间的关系。希望与基础研究实验室合作开展Caspase-10γ在免疫、肿瘤疾病方面的功能和应用研究。与临床实验室合作开展检测Caspase-10γ在不同的临床样本中的蛋白表达水平。

联系人: 石太平,Tel:67883332-868; Email: taiping_shi@yahoo.com.cn
吴俊,Tel: +86 21 50802786; Email: junwu@shanghaigenomics.com

参考文献:
1. Hui Wang , Pingzhang Wang , Xiaoqing Sun , Ying Luo, Xin Wang , Dalong Ma, Jun Wu . Cloning and characterization of a novel caspase-10 isoform that activates NF-κB activity. Biochim Biophys Acta. 2007 Nov;1770(11):1528-37.




北京大学人类疾病基因研究中心
2008.2.22