PDCD10
 

 

一•  发现和命名

本实验室于 1999 年应用 cDNA- RDA 技术和 RACE 技术,从撤除粒细胞-巨噬细胞集落刺激因子( granulocyte macrophage colony-stimulating factor , GM-CSF )而诱导凋亡的 TF-1 细胞中克隆到的上调表达的基因,起初命名为 TFAR15 ( TF-1 cell apoptosis related gene 15 ) [1] ,后经国际人类基因命名委员会统一命名为 PDCD10 ( programmed cell death 10 )。

二•  结构和表达谱

PDCD10 的基因定位于 3q26.2 ,包括 10 个外显子和 9 内含子,开放读码框为 616bp ,编码 212 个氨基酸,其中不含色氨酸和半胱氨酸,意味着该蛋白在折叠过程中没有二硫键的排列问题,在 348nm 附近也没有自发荧光出现。推测的分子量为 24657.5 道尔顿,等电点为 8.58 。生物信息学分析表明 PDCD10 没有信号肽,无穿膜区,无 DNA 结合区,与已知的人类基因没有同源性。

PDCD10 的表达广泛,在胎儿肝、肾、脾、肺组织中 , 该基因的表达均为阳性,并且在人髓系白血病细胞 HL-60 中随血清的去除而表达增强 [1] 。 Bergametti 等所作的人体不同组织中 PDCD10 的 Northern blot 分析显示, PDCD10 mRNA 在胎盘组织中含量相当高,肝肾中也很强,除在结肠中表达比较弱以外,脑、心、骨骼肌、胸腺、脾、小肠、肺和外周血白细胞都有表达 [2] 。

三•  功能

本实验室的早期功能研究表明 [1] ,重组 PDCD10 蛋白可以抑制 293 细胞在有血清的正常培养条件下的凋亡,但不能抑制撤除细胞因子诱导的 TF-1 细胞的凋亡,说明 PDCD10 是选择性的对某些原因引起的凋亡起到抑制作用。但这种选择性的机理是什么,尚待进一步验证。 Kamath 等人 [3] 用 RNAi 的方法系统的对线虫基因组进行功能性分析,发现将人 PDCD10 在线虫中的同源类似物 2K896 封闭表达以后,导致 40 %的胚胎死亡。在存活的胚胎中,胚胎后期出现短粗表型,但到目前为止封闭 2K896 导致这些表型的信号途径和机制仍然有待于研究。

2005 年,法国的 Bergametti 等人 [2] 通过对 20 个颅内海绵状血管瘤( Cerebral cavernous malformations , CCM )家系的高密度微卫星基因型扫描,证明 CCM3 基因即为 PDCD10 。这一重要实验结果为研究 CCM 的病因学、症状前基因诊断学和基因治疗提供了新思路,同时也证明了 PDCD10 是重要功能的人类基因,除了参与凋亡调控外,还可能参与血管生成的调控,为 PDCD10 研究提供了新的方向。

近来,我们通过酵母双杂交实验,首次发现 PDCD10 与 Ste20 家族蛋白激酶 MST4 的相互作用,并经免疫共沉淀进一步证实。我们发现 PDCD10 与 MST4 相互作用可以通过调节 ERK MAPK 通路促进细胞的增殖和转化,而抑制 PDCD10 或 MST4 的表达可以降低肿瘤细胞系的增殖能力。单独过表达 PDCD10 或 MST4 都可以促进细胞的增殖,而共同过表达的促增殖作用远远强于单独过表达其中的一个分子。通过向肿瘤细胞系中转染抑制 PDCD10 或 MST4 表达的 siRNA ,都可以抑制细胞的增殖。 PDCD10 和 MST4 的相互作用可以激活 ERK MAPK 通路,而抑制 PDCD10 或 MST4 表达后则不能激活 ERK MAPK 通路。另外,不论是内源性还是过表达的 PDCD10 都可以在体外增加 MST4 的激酶活性,其中过表达的 PDCD10 的激活作用是对照的三倍以上 [4] 。

上述功能研究结果显示,它不仅与细胞增殖密切相关,也是遗传性疾病 CCM 的重要致病因子,这些使得 PDCD10 这个分子在生物学上变得十分重要。

四•  合作意向

目前,本中心正在进一步开展 PDCD10 的功能和分子作用机理的研究,已经证明 PDCD10 可以结合两种蛋白激酶,通过调节激酶活性发挥促进增殖和抗凋亡的活性。本中心已经制备了抗 PDCD10 单克隆抗体,构建了 PDCD10 真核表达质粒、原核表达质粒、 GFP 细胞定位表达质粒、腺病毒表达克隆等,希望与基础研究实验室合作开展 PDCD10 在神经、免疫、血管生成、肿瘤等方面的功能和应用研究;与临床实验室合作开展不同疾病情况下 PDCD10 的表达水平检测。

联系人:赵 红珊副 教授, Tel:82802846-420; Email: hongshan@bjmu.edu.cn

 

参考文献:

1、  Wang YG, Liu HT, Zhang YM, et al. (1999) cDNA cloning and expression of an apoptosis-related gene, human TFAR- 15 gene. Science in China series C-life sciences 42: 323-329

2、  Bergametti F, Denier C, Labauge P, et al.(2005) Mutations within the Programmed Cell Death 10 Gene Cause Cerebral Cavernous Malformations. Am J Hum Genet 76: 42-51

3、  Kamath RS, Fraser AG, Dong Y, et al. (2003) Systematic functional analysis of the Caenorhabditis elegans using RNAi. Nature. 421: 231-236

4、  Ma X, Zhao H, Shan J, et al. PDCD10 Interacts with Ste20-related Kinase MST4 to Promote Cell Growth and Transformation via Modulation of ERK Pathway. (2007) Mol Biol Cell, 18: 1965-1978

5、  陈菊祥 , 范静平 , 应 康等 . (2001) 基因表达谱芯片发现 36 条喉鳞癌相关基因 . 第二军医大学学报 , 22 : 519-522.

6、  Nanjundan M, Nakayama Y, Cheng K W, et al. (2007) Amplification of MDS1/EVI1 and EVI1, Located in the 3q26.2 Amplicon, Is Associated with Favorable Patient Prognosis in Ovarian Cancer. Cancer Res, 67: 3074-84.

7、  Cardoso J, Boer J, Morreau H, et al. (2007) Expression and genomic profiling of colorectal cancer. Biochim Biophys Acta, 1775: 103-37.

8、  Gibson S, Shillitoe E J. (2006) Analysis of apoptosis-associated genes and pathways in oral cancer cells. J Oral Pathol Med, 35: 146-54.

9、  Guclu B, Ozturk A K, Pricola K L, et al. Mutations in apoptosis-related gene, PDCD10, cause cerebral cavernous malformation 3. (2005) Neurosurgery, 57: 1008-13.

10、  Verlaan D J, Roussel J, Laurent S B, et al. (2005 ) CCM3 mutations are uncommon in cerebral cavernous malformations. Neurology, 65: 1982-3.

11、  Liquori C L, Berg M J, Squitieri F, et al. (2006)Low frequency of PDCD10 mutations in a panel of CCM3 probands: potential for a fourth CCM locus. Hum Mutat, 27: 118.

12、  Liquori C L, Berg M J, Squitieri F, et al. (2007) Deletions in CCM2 are a common cause of cerebral cavernous malformations. Am J Hum Genet, 80: 69-75.

13、  Chen P Y, Chang W S, Chou R H, et al. (2007) Two non-homologous brain diseases-related genes, SERPINI1 and PDCD10, are tightly linked by an asymmetric bidirectional promoter in an evolutionarily conserved manner. BMC Mol Biol, 8:2.

14、  Aguirre A J, Brennan C, Bailey G, et al. (2004) High-resolution characterization of the pancreatic adenocarcinoma genome. Proc Natl Acad Sci U S A, 101: 9067-72

 

本中心发表的 PDCD10 TFAR15 )的论文:

1、  王玉刚,刘红涛,张颖妹,马大龙 一个人类凋亡相关新基因 TFAR15 的 cDNA 克隆化与表达 中国科学( C 辑) 1999 , 42: 323–329

2、  陈瑶瑶,赵云罡,张婷,许兰俊,马曦,赵红珊,陈英玉 抗人 PDCD10 单克隆抗体的制备和鉴定 北京大学学报(医学版) 2006, 38(6) : 586 - 591

3、  孙荣华 黄家强 韩文玲 王应 马大龙 , 小鼠凋亡相关新基因 TFAR15 的克隆和序列分析 . 细胞与分子免疫学杂志, 2000, 16 (2) : 97

4、  Xi Ma, Hongshan Zhao , Jingxuan Shan, Feng Long, Yaoyao Chen , Yingyu Chen , Yingmei Zhang, Xiao Han, Dalong Ma. PDCD10 Interacts with Ste20-related Kinase MST4 to Promote Cell Growth and Transformation via Modulation of ERK Pathway. Mol Biol Cell 2007, 18: 1965-1978

5、  马 曦 , 赵红珊 , 马大龙 : 人程序性细胞死亡因子 10 (PDCD10) :不仅与细胞凋亡相关 . 生物化学和生物物理进展杂志。 2007, 34 (8):86

 

PDCD10 相关专利:

200710063787.6 抗细胞增殖或抗肿瘤药物的筛选试剂盒、筛选方法及用途 赵红珊,马曦,马大龙,陈英玉,陈瑶瑶,张颖妹 申请日 2007 年 2 月 9 日

其它实验室引用 PDCD10 TFAR15 SCI 论文 :

1、  Bergametti F, Denier C, Labauge P, et al.(2005) Mutations within the Programmed Cell Death 10 Gene Cause Cerebral Cavernous Malformations. Am J Hum Genet 76: 42-51 (引用王玉刚文章)

2、  Liquori C L, Berg M J, Squitieri F, et al. (2006)Low frequency of PDCD10 mutations in a panel of CCM3 probands: potential for a fourth CCM locus. Hum Mutat, 27: 118. (引用王玉刚文章)

3、  Revencu N and Vikkula M (2006) Cerebral cavernous malformation: new molecular and clinical insights Journal of Medical Genetics 43:716-721 (引用王玉刚文章)

4、  Chen P Y, Chang W S, Chou R H, et al. (2007) Two non-homologous brain diseases-related genes, SERPINI1 and PDCD10, are tightly linked by an asymmetric bidirectional promoter in an evolutionarily conserved manner. BMC Mol Biol, 8:2. (引用王玉刚文章)

5、  Petit N, Ble′con A, Denier C, Tournier-Lasserve E. (2006) Patterns of expression of the three cerebral cavernous malformation (CCM) genes during embryonic and postnatal brain development Gene Expression Patterns 6 :495–503 (引用王玉刚文章)

6、  Voss K, Stahl S, Schleider E, et al. (2007) CCM3 interacts with CCM2 indicating common pathogenesis for cerebral cavernous malformations. Neurogenetics 8:249-256 (引用马曦文章)

7、  Rohlfs M, Arasada R, Batsios P, Janzen J, and Schleicher M. (2007) The Ste20-like kinase SvkA of Dictyostelium discoideum is essential for late stages of cytokinesis. J. Cell Sci: 120(24): 4345 - 4354. (引用马曦文章)

8、  Ling P, Lu TJ, Yuan CJ and Lai MD (2008) Biosignaling of mammalian Ste20-related kinases Cell Signal, in press (引用马曦文章)

 

北京大学人类疾病基因研究中心

2008 年 3 月 14 日